Le territoire du Grand Cubzaguais présente de nombreux espaces naturels intéressants du point de vue de la biodiversité, au sein d’une matrice agricole, urbaine et péri-urbaine, et dont il faut nécessairement tenir compte et prendre acte dans les perspectives de développement à venir.

Plusieurs d’entre eux bénéficient en ce sens de dispositifs de protection spécifiques et sont reconnus pour leur intérêt faunistique, floristique ou écologique tant au niveau national qu’européen (par ex. les ZNIEFF, les ZSC du réseau Natura 2000, la réserve de biosphère de la Dordogne).

La protection des espaces naturels et de la biodiversité passe aussi par la préservation et la restauration des continuités écologiques qui doivent notamment permettre de lutter contre la consommation et la fragmentation de l’espace, ce qui constitue une des principales causes d’érosion de la biodiversité en France métropolitaine.

Néanmoins, les zonages écologiques subissent des pressions et des pollutions multiples : développement de l’urbanisation, pollutions d’origine agricole ou urbaine, fréquentation estivale, développement des sports de pleine-nature. En effet, le territoire du Grand Cubzaguais est représentatif des territoires périurbains où la pression foncière est forte et fait peser de lourdes menaces sur les paysages, la biodiversité et les continuités écologiques.

La biodiversité peut être également fragilisée par les effets du changement climatique. L’augmentation de température influe sur les aires de répartition et les cycles de la vie des espèces (floraison, feuillaison et fructification pour les végétaux, mouvements migratoires, nidification) : ces conséquences pourraient aller jusqu’à la fragilisation des populations endémiques. Les milieux humides sont les milieux les plus vulnérables au changement climatique avec plusieurs types de conséquences probables : réduction des niveaux d’eau, augmentation des risques d’eutrophisation (dégradation générale de la qualité écologique des milieux).

Avec cette action « Protéger et restaurer les écosystèmes sensibles », il s’agit d’une part de préserver les espaces naturels, d’un point de vue réglementaire et technique ; et d’autre part de réaliser les études environnementales préalables aux projets d’aménagement.